病毒載體構建穩(wěn)定細胞株有什么優(yōu)勢？
　　化學試劑介導的轉(zhuǎn)染方法和電轉(zhuǎn)，整合率低，同時整合位點不穩(wěn)定，易發(fā)生再次丟失的情況，而且整合位點一般都在轉(zhuǎn)錄活躍區(qū)之外，所以并不是理想的穩(wěn)定整合工具。另外，整合后的拷貝數(shù)是由核內(nèi)的外源DNA局部濃度，而不是轉(zhuǎn)染時的DNA的量決定，而化學方法在輸入質(zhì)粒載體入核的效率比電轉(zhuǎn)和病毒載體相比要低得多，導致其轉(zhuǎn)染相同細胞所用質(zhì)粒載體用量要大大高于其它方法，造成入核質(zhì)粒載體量難以控制，這也解釋了為什么化學轉(zhuǎn)染方法和其它兩種方比，更傾向于得到串聯(lián)多拷貝。以上種種因素，導致使用非病毒載體轉(zhuǎn)染方法構建穩(wěn)定株，成功率低，穩(wěn)定性差，穩(wěn)定克隆株易出現(xiàn)不均一(含有非整合細胞)等缺點。
　　逆轉(zhuǎn)錄病毒載體由于整合率高，是非常理想的穩(wěn)定株構建工具。而且通過控制逆轉(zhuǎn)錄病毒載體轉(zhuǎn)導的實驗條件，理論上可以確保每個細胞只有單拷貝插入。同時由于病毒載體是通過病毒重組酶將外源片段整合入染色體中，其整合特性和病毒自身整合特性非常相似：偏向于轉(zhuǎn)錄活躍區(qū)段，且整合后非常穩(wěn)定，在傳代100次后仍然保留在宿主基因組中。重要的是整合幾率和所有其它化學，物理轉(zhuǎn)染方法比，增加5至6個數(shù)量，使得穩(wěn)定株構建不再成為實驗研究的障礙。由于整合幾率非常高，所以很容易獲得混合穩(wěn)定株。
　　腺病毒載體整合率和普通轉(zhuǎn)染方法差異不大，被認為是不能整合的一類病毒載體，因此相關研究數(shù)據(jù)較少，不建議用來構建穩(wěn)定株。非野生型腺相關病毒載體(Rep-)整合率較低，但因為野生型病毒載體可以定點將病毒基因組整合于人19號染色體，所以從安全性和穩(wěn)定性角度來說，潛力都非常巨大。由于諸多因素，研究人員仍然在對其進行改造中，包括考慮到嚙齒類動物不含有人19號染色體對應的整合位點序列。